过去认为，口腔溃疡发病原因不明。现在发现，口腔溃疡的发生，尤其是反复发生，与自身免疫功能一时降低或长期低下有直接关系。
口腔溃疡常发生在患感冒、咽炎、腹泻或其他疾病之后和患慢性病的过程中，如发生在使用激素、抗生素、免疫抑制剂之时。生活规律失常、饮食不周、消化不良、精神紧张、长期便秘、熬夜少眠、过度劳累等情况发生时，自身免疫力有所降低，也会导致口腔溃疡。所以，在临床上常常是采用维生素B或复合维生素治疗不见效果，使用抗生素治疗无明显疗效，溃疡处涂药粉也不能治愈，而且这些疗法都不能防止口腔溃疡反复发生。
口腔溃疡的治疗应采取增强自身免疫功能的措施。同时，应避免可导致自身免疫力降低的因素，以从根本上防治口腔溃疡。
