牙周病的主要原因是牙菌斑，简单地说就是口腔卫生不良所引起的破坏。牙菌班的主要成份是细菌，并交杂着一些口内已脱落细胞及一些有机物，但不是一般大块的食物残渣。牙菌斑通常肉眼难见，必须使用牙菌斑染色剂才能显示。如果任凭牙菌斑滋长，则会看到牙齿表面堆积着一层黄白色略呈颗粒状的东西，这就是一层很厚的牙菌斑。
牙菌斑在牙齿或口腔其他硬组织上细菌的堆聚；最常见于牙齿表面及牙龈沟上，呈粘粘的糊状物。它不易以肉眼看出，通常借助牙菌斑染色剂在牙齿和牙龈上染色，然后让病人漱口，是漱不掉的染色部分就是牙菌斑所存在的位置！
牙菌斑中含有许多细菌，这些细菌有些会产生有害物质，有些会引起身体局部组织免疫力降低而引发牙周病！
